河口是咸淡水交汇区，由于淡水的持续输入和周期性潮汐作用，河口区不仅具有大的环境梯度，其环境条件也不断发生变化。此外，由于淡水输入量和海水环境特征都存在季节性差异，对浮游微生物群落结构和分布格局的影响异常复杂。为厘清河口区浮游微生物群落结构的动态特征，前期研究运用高通量测序技术对长江口和珠江口浮游微生物群落结构、网络特征、季节动态和群落结构组装机制等展开研究。主要结论包括：1)  盐度是决定河口区细菌群落结构最主要的因素；2) 河口区细菌群落结构特征主要受地理位置的影响，季节变化的影响弱于地理位置的影响；3）河口区微生物共现网络较口外更紧密，但抗毁性更弱；4)  长江口细菌群落结构组装机制以随机过程为主，主要是受长江径流输入的影响。相关研究成果发表于Marine Environmental  Research、Microorganism等期刊。